El Programa 2014-2020 intervendrá en cinco grandes ámbitos u objetivos temáticos:
Eje 1 : Potenciar la investigación, el desarrollo tecnológico y la innovación.
Eje 2 : Mejorar la competitividad de las empresas.
Eje 3 : Promover la adaptación al cambio climático y la prevención y gestión de riesgos.
Eje 4 : Conservar y proteger el medio ambiente y promover la eficiencia de los recursos.
Eje 5 : Mejorar la capacidad institucional y la eficiencia de la administración pública.